El IESTP “San Juan Bautista”; desde su inicios estuvo sometido a constantes cambios en su denominación y a nivel de estructura organizativa; es así que se creó el Instituto Superior Pedagógico Estatal “San Juan Bautista”, con sede en la capital de la provincia de Huaytará con la R.E.R., N° 169-92-GRLW/P de fecha 02 de Marzo de 1992 posteriormente fue reconocida por el ministerio de educación en vía de regularización, con el D.S Nº 04-94-ED de fecha 05 de Mayo de 1994; Seguidamente en el año 2007; el gobierno de Alan García. Suspende todo ingreso a los IESP Público y privados a nivel nacional, motivo por el cual nuestro instituto empieza a perder presupuesto para contrato de docentes por racionalización; es así que en el año 2008 los directores y docentes hacen la gestión de creación de carreras profesionales tecnológicas; logrando la autorización al IESPP “SJB” a ofertar las carreras profesionales técnicas de Computación e Informática y de Industrias alimentarias mediante la R.D. N° 0160-2008-ED, de fecha 27-06-2008. En el año 2011, nuevamente nuestro instituto es evaluado en el proceso de adecuación según R.M N° 0023-2010-ED, Conforme al plan de adecuación a la Ley N°29394, ley de Institutos y Escuelas de Educación Superior, tomando el nombre de instituto Superior de Educación Público “SJB” con la R.D.R. N° 00787-2011-DREH de fecha 10-08-2011 y rectificada con R.D.R. N° 01174-2011-DREH de fecha 19-10-2011; en el año 2018 nuevamente el instituto se adecua a lo establecido por la ley N° 30512 y su reglamento D.S. N° 010-2017-MINEDU; en cumplimiento a la R.M N° 086-2018-MINEDU la DREH adecua a IESTP “SJB” con la R.D.R N° 0565-2018-DREH de fecha 20-04-2018. Desde el año 1992 hasta el año 2010 el instituto ha formado 15 promociones en pedagogía y hasta el año 2024 se ha formado 14 promociones de profesionales técnicos en los programas de estudio.